Ik ben wetenschapper! Ik werk als bio-informaticus bij het Centrum voor Moleculaire Geneeskunde, in de onderzoeksgroep van Maria Rodríguez-Colman.
Celvolgen
We nemen filmpjes op van groeiende organoïden, en kijken hoe de cellen zich bewegen, wanneer ze delen en wanneer ze dood gaan.
R.N.U. Kok, L. Hebert, G. Huelsz-Prince, …, S.J Tans, J.S van Zon OrganoidTracker: efficient cell tracking using machine learning and manual error correction PLOS ONE 2020
M.A. Betjes, X. Zheng, R.N.U. Kok, J.S. van Zon, S.J. Tans Cell Tracking for Organoids: Lessons From Developmental Biology Frontiers in Cell and Developmental Biology 2021
Metabolisme
Van micro-organismen is het bekend dat sterk reageren op de aanwezige voedingsstoffen, de metabolieten. Laat ergens een glas melk te lang staan, en de bacteriën gaan een feestje bouwen. Anders dan men lang dacht, werkt het bij menselijke cellen ook zo (zie bijvoorbeeld Quanta Magazine). Maria’s lab onderzoekt hoe het metabolisme van de cel bepaalt wat de cel gaat doen – delen, van celtype veranderen, etc. – in gezond weefsel en in tumoren.
N.T.B. Nguyen, S. Gevers, R.N.U. Kok, …, M.J. Rodríguez Colman Lactate controls cancer stemness and plasticity through epigenetic regulation Cell Metabolism 2025
Wnt-signalering
Cellen communiceren met elkaar via signaalwegen. Er zijn zo’n 15 standaard signaalwegen die overal in ons lichaam (en in dieren) voorkomen, en nog een hele rits meer gespecialiseerde. De Wnt-signaalweg is een belangrijke, want deze zet cellen aan tot groei en celdeling. In kankertumoren staat deze signaalroute vaak altijd aan, waardoor cellen maar blijven delen.
J. Sprangers, J.M. Bugter, D. Xanthakis, …, M.M. Maurice WNT7B drives a program for pancreatic cancer subtype switching and progression pre-print 2024
R.N.U. Kok, Xuan Zheng, W. Kasper Spoelstra, …, Sander Tans, Jeroen van Zon Loss of Paneth cell contact starts a WNT differentiation timer in intestinal crypts pre-print 2024